Από τον Γιαννούλη μέχρι τον Γκουγκεσασβίλι και από τον Λύρατζη μέχρι τον Λημνιό η σχέση του ΠΑΟΚ και του Ατρομήτου όσον αφορά τις μεταγραφές παικτών είναι μεγάλη.
Η πρώτη μεταγραφή χρονολογείται το 2005 όταν ο Νικόλαος Σκαρμούτσος έφυγε ως ελεύθερος από τον Δικέφαλο και υπέγραψε στον Ατρόμητο. Αντίθετα, η πιο πρόσφατη είναι αυτή του Λευτέρη Λύρατζη, ο οποίος αποχώρησε και αυτός ως ελεύθερος μετά από την πολυετή παρουσία του στον ΠΑΟΚ και πλέον ανήκει στο δυναμικό της ομάδας του Περιστερίου.
Μέσα σε αυτά τα 21 χρόνια οι «μετακομίσεις» παικτών είναι συχνές μεταξύ των δύο ομάδων, είτε ως μεταγραφές, είτε ως δανεισμοί, ενώ δεν αφορούν μόνο την πρώτη ομάδα, αλλά και τις ακαδημίες των συλλόγων.
Παρακάτω όλοι οι παίκτες που έχουν φορέσει τις φανέλες και των δύο ομάδων:
