Η μεταγραφή στην Άιντραχτ άλλαξε αμέσως τις παραστάσεις του Κρίστιαν Γιάκιτς. Στην πρώτη σεζόν του στη Γερμανία έπαιξε 38 φορές και έγινε κομμάτι μιας πορείας που κατέληξε στην κατάκτηση του Europa League.
Έπαιξε σχεδόν σε ολόκληρη τη διοργάνωση, απουσιάζοντας από τον πρώτο ημιτελικό με τη Γουέστ Χαμ λόγω τιμωρίας. Στον τελικό της Σεβίλλης απέναντι στη Ρέιντζερς πέρασε στο γήπεδο στο 90′, αγωνίστηκε σε ολόκληρη την παράταση και πανηγύρισε μέσα από τον αγωνιστικό χώρο την κατάκτηση του τροπαίου στα πέναλτι.
Η επόμενη σεζόν τού έφερε το Champions League. Ο Γιάκιτς αγωνίστηκε και στα οκτώ ευρωπαϊκά παιχνίδια της Άιντραχτ, έξι στον όμιλο και δύο απέναντι στη Νάπολι στους «16».
Στο μεταξύ είχε ανοίξει και η πόρτα της Εθνικής Κροατίας. Την πρώτη κλήση του την πληροφορήθηκε μετά από προπόνηση στη Φρανκφούρτη, όταν το κινητό του γέμισε μηνύματα. Έμεινε για λίγο καθισμένος στα αποδυτήρια, προσπαθώντας να συνειδητοποιήσει τι είχε συμβεί.
Τον Δεκέμβριο του 2022 βρισκόταν στο Κατάρ. Στον μικρό τελικό με το Μαρόκο μπήκε στις καθυστερήσεις. Ένα λεπτό στο γήπεδο ήταν αρκετό για να φύγει από το πρώτο Μουντιάλ της ζωής του με ένα χάλκινο μετάλλιο.
